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NiftyReg reg_resample entraîne des artefacts étranges lors de l'enregistrement de l'atlas MNI-ICBM-152

NiftyReg reg_resample entraîne des artefacts étranges lors de l'enregistrement de l'atlas MNI-ICBM-152

J'utilise NiftyReg pour l'enregistrement d'images et j'ai plusieurs artefacts lors de l'application de la déformation à partir d'un enregistrement non linéaire de l'atlas MNI-ICBM-152 standard de facto.

Voici quelques tranches montrant les artefacts :

J'ai testé l'enregistrement sur l'atlas GG-366-0,7 mm T1 (après décapage du crâne avec BET de FSL) Voici les commandes que j'ai exécutées :

reg_f3d -ref GG-366-T1-0.7mm.brain.nii.gz -flo MNI-ICBM-152-T1.brain.nii.gz -res MNI-ICBM-152-T1.nlin-GG.nii.gz - cpp MNI-ICBM-152-T1.nlin-GG.cpp.nii.gz reg_resample -ref GG-366-T1-0.7mm.brain.nii.gz -flo MNI-ICBM-152-WM.nii.gz -trans MNI-ICBM-152-WM.nlin-GG.cpp.nii.gz

Ceci utilise la dernière version git de Nifty-Reg. En utilisant la dernière version stable (1.3.9), le résultat est le même, mais le programme reg_resample prend le paramètre -cpp au lieu de -trans.

Avez-vous une idée s'il s'agit d'un bogue dans Nifty-Reg ou si cela peut être contourné?